计量学报

北大核心,JST,CSCD扩展版,WJCI,

国内刊号:11-1864/TB

国际刊号:1000-1158

计量学报杂志2023年第3期:一种模拟游离DNA阳性质控品的制备方法及表征

发布日期:

作者:方艳,王霞,董莲华,杨靖亚

单位:1. 上海海洋大学食品学院,上海201306; 2. 中国计量科学研究院前沿中心,北京100029;

关键词:计量学; 游离DNA; 阳性质控品; 模拟cfDNA;突变丰度; 数字PCR

基金:战略性国际科技创新合作重点专项(2018YFE0201602)

通过优化一种新型的机理未明确的类酶解作用体系(reaction system,RS),直接作用带有KRAS G12C,KRAS G12D,EGFR L858R和EGFR T790M突变的肿瘤细胞系SW1573,SNU-C2B和NCI-H1975,通过对RS体系作用时间及作用的细胞数量的优化,可以裂解细胞基因组DNA制备得到一种可以高度模拟人体血浆游离DNA(cfDNA)阳性质控品。经芯片电泳检测获得的模拟cfDNA片段长度集中于(166±16)BP,与正常人体血浆cfDNA大小一致;通过微滴数字PCR检测显示RS制备的DNA片段和gDNA在目标突变位点处具有一致的突变丰度。表明经RS体系制备得到的DNA片段可以作为一种cfDNA的阳性质控品。

来源:2023年第3期

《计量学报》期刊编辑部

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