计量学报

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国内刊号:11-1864/TB

国际刊号:1000-1158

计量学报杂志2023年第5期:RNA内参在转录组测序质量控制中的应用

发布日期:

作者:张瑜,王霞,张永卓,杨佳怡,牛春艳,赵洋,董莲华

单位:中国计量科学研究院 前沿计量科学中心,北京 100029

关键词:计量学;转录组测序;RNA内参;标准物质;质量控制

基金:中国计量科学研究院基本科研业务费重点领域项目(AKYZD2202)

真核生物转录组多样且复杂,通过转录组测序可以获得基因表达的整体信息,发现与疾病相关的标志物,为复杂疾病的诊疗提供支持。转录组测序包括样品制备、建库、测序和数据分析等步骤,每个步骤中存在的误差都会影响转录组测序结果的准确性。利用RNA内参(RNA spike-in)对转录组测序进行质控,可以发现并减少这些误差,提升测序数据结果的可靠性。因此,对RNA spike-in进行介绍,并对其在转录组数据标准化、基因表达量的校正、转录本多样性的识别及量化中的应用进行了重点综述,可为有效利用RNA spike-in提升转录组测序的质量提供参考。

来源:2023年第5期

《计量学报》期刊编辑部

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